“Llibre que conté les Poesies d’en Francesc Pujols”.
Barcelona: Tobella & Costa impressors, 1904. Barcelona: Quaderns Crema, 2004

“El Nuevo Pascual o la Prostitución, novela compuesta por Don Augusto de Altozanos”.
Barcelona: Castells, 1906. Vilafranca del Penedès: Edicions i Propostes Culturals Andana, 2005

“El mal del separatismo catalán”.
Barcelona (Opuscle sota el pseudònim d’Augusto de Altozanos), 1906

“Concepte general de la ciència catalana”.
Barcelona: Antoni López, 1918. Barcelona: Editorial Pòrtic, 1983

“La Catalunya pintoresca”.
Barcelona: Salvat-Papasseit Llibreters (amb dibuixos de Xavier Nogués), 1919

“L’evolució i els principis immutables”.
Barcelona: Llibreria Verdaguer, 1921

“La Religió i la moral”.
Barcelona: Antoni López 1921.
Barcelona: Associació Francesc Pujols, 2002

“Recull d’articles de crítica artística”.
Barcelona: Publicacions de La Revista, 1921

“Llibre de Job. Traducció parafràsica”.
Barcelona: Llibreria Nacional Catalana, 1922

“Medeia”.
Barcelona: Impremta A. López Llausàs, 1923

“Història de l’hegemonia catalana en la política espanyola” (2 vols.).
Barcelona: R. Tobella impressor, 1926

“La visió artística i religiosa d’en Gaudí”.
Barcelona: Llibreria Catalònia, 1927. Quaderns Crema, 1996. 2002 Quaderns Crema

“Catalunya i el Marroc”.
Barcelona: Llibreria Catalònia, 1928

“La solució Cambó”.
Barcelona: Llibreria Catalònia, 1931

“La rabassa morta”.
Barcelona: Impremta Porcar, 1932

“El Pintor Pidelaserra”.
Barcelona: Syra, 1934

“Un llibre estel de Joaquim Casas-Carbó”.
Barcelona: Llibreria Catalònia, 1935

“El problema peninsular”. 1935

“La vision artistique et religeuse de Gaudí”.
Traducció de Salvador Dalí. Lausana, 1970.

“Articles”.
Barcelona: Quaderns Crema, 1983

“Hparxiologi”.
Barcelona: Llibres de L’Índex, 2003

“La tardor barcelonina”.
Llibres de l’Índex, 2005

L’any 1922 va fer tres adaptacions a l’escena lírica: El Castell dels Tres Dragons i El Ferrer del Tall, de Serafí Pitarra. Barcelona: Salvador Bonavia Llibreter. Don Joan de Serrallonga, de Víctor Balaguer. Barcelona: Salvador Bonavia Llibreter.
 

Artur Bladé i Desumvila: “Francesc Pujols per ell mateix”.
Barcelona: Editorial Pòrtic, 1967.

Artur Bladé: “Moraguetes (El senyor Moragues)”.
Barcelona: Editorial Pòrtic, 1970

Artur Bladé: “Geografia espiritual de Catalunya”.
Mèxic, 1944. Barcelona: Llibres de l’Índex, 2004

Isidre Clopas: “Anecdotologi de Francesc Pujols”.
Barcelona: Editorial Selecta, 1953

Josep Pla: “El sistema de Francesc Pujols. Manual d’Hiparxiologia”.
Barcelona: Llibreria Catalònia, 1931

Miquel Utrillo: “Anecdotari d’en Francesc Pujols”.
Barcelona: Biblioteca Catalana d’Autors Independents, 1930